色谱柱箱温度，步进影响色谱过程的热力学因素，也是影响传质过程的动力学因素。柱温变化，不仅影响柱前端压力、载气流速等，更重要的是它会对物质的分离、分析结果带来影响。那么如何选择适合的色谱柱箱温度那？
气象色谱中，柱温是影响化合物保留时间的重要因素。使用中应注意柱温的选择，因为一下几个方面均与柱温有关。
（1）色谱柱固定液的寿命：若柱温高于固定液的最高使用温度，则会使固定液随载气流失，不但影响色谱柱的寿命，而且固定液随载气进入检测器，将污染检测器，影响分析结果。
（2）分离效能和分析时间：若柱温过高，则会使各组分的分离系数变小，分离度减小；但柱温过低，则传质速率显著降低，柱效能下降，而且会延长分析时间。
（3）化合物保留时间：柱温越高，出峰越快，保留时间越小。柱温变化会造成保留时间的重现性不好，从而影响样品组分的定性结果。一般，柱温变化1%组分保留时间变化5%；如果柱温变化5%，则组分的保留时间变化20%。
（4）色谱峰峰形：柱温升高时，正常情况下回导致半峰宽变窄，峰高变高，峰面积不变。但是组分分高变高，以峰高进行定量时，分析结果可能产生变化；柱温降低，则相反。
所以在柱温选择时需要从以下几个方面出发。
首先，应保证柱温不高于固定液的最高使用温度，即色谱柱的最高耐受温度，避免固定液流失而影响色谱柱柱效和使用寿命。
其次，选择适合的柱温，柱温的选择以使难分离的两组分达到预期的分离效果，峰形正常而分析时间较短为宜，一般柱温应比试样中各组分的平均沸点低20-30摄氏度，通过实验决定。对于沸点范围较宽的试样，应采用程序升温，按预定的升温速率随时间线性或非线性的增加温度，一般升温速率是成。
最后，特别是要保证仪器柱温控制的稳定性、均匀性，以及实际温度与预设温度之间的一致性。一般气相色谱仪柱温控温精度在±0.1摄氏度，也有能达到±0.01摄氏度。
